Sekolah Tinggi Teologia Nias (STT Nias) memiliki Program Studi :

1. S1 – Pendidikan Agama Kristen (S.Pd)
2. S1 – Teologia (S.Th)
3. S2 – Magister Pendidikan Agama Kristen (M.Pd)
4. S2 – Magister Teologia (M.Th)